Mikroskooppi (
kreikasta:
micron = pieni ja
scopos = tähdätä) on
optinen laite, jonka avulla ihmissilmin näkymätön (eli
mikroskooppisen pieni) hiukkanen – esimerkiksi
solu tai
bakteeri – voidaan nähdä suurennettuna.
Mikrobiologian kehitys on ollut riippuvainen mikroskooppien teknisestä kehityksestä, erityisesti
erotuskyvyn eli
resoluution lisäyksestä.