Pistemutaatio on
mutaatio, jonka seurauksena yksi emäs vaihtuu toiseksi DNA-ketjussa. Virhe voi syntyä esimerkiksi jakautumisen yhteydessä, kun jakautumista hoitavat
entsyymit korjaavat molekyylin väärin. Pistemutaatioita ovat transitiomutaatiot ja transversiomutaatiot. Edellisissä
puriiniemäs (
adeniini,
guaniini) vaihtuu toiseksi puriiniemäkseksi tai
pyrimidiiniemäs (
tymiini,
sytosiini) toiseksi pyrimidiiniemäkseksi, jälkimäisissä puriiniemäs vaihtuu pyrimidiiniemäkseksi tai päinvastoin.